Перечислить НДФЛ с отпускных в бюджет нужно в последний день месяца, за который работнику начислены отпускные.

НДФЛ с отпускных нужно перечислить в бюджет в последний день месяца, за который работнику начислены отпускные. Об этом сказано в постановлении ФАС Западно-Сибирского округа от 29.12.2009 по делу № А46-11967/2009. Судом  отпускные были приравнены к оплате труда и при разрешении спора Суд руководствовался положениями пункта 2 статьи 223 НК РФ.
Аналогичные выводы содержатся и в других материалах арбитражной практики ( постановления ФАС Уральского округа от 04.03.2008 № Ф09-982/08-С2, ФАС Центрального округа от 15.12.2006 по делу № А23-1664/06А-14-123). Однако контролирующие органы указанный подход поддерживають отказываются. В письме Минфина России от 06.03.2008 № 03-04-06-01/49 содержится вывод, что оплата отпуска не является выплатой за выполнение трудовых обязанностей, поскольку в соответствии со статьями 106 и 107 ТК РФ отпуск - это время, в течение которого работник свободен от исполнения трудовых обязанностей. Поэтому дата фактического получения дохода в виде оплаты отпуска должна определяться в соответствии с подпунктом 1 пункта 1 статьи 223 НК РФ как день выплаты этого дохода, в том числе перечисления дохода на счета налогоплательщика в банках. Соответственно, по мнению Минфина, налоговый агент должен уплатить НДФЛ с суммы отпускных не позднее дня фактического получения в банке наличных денежных средств на выплату дохода либо дня перечисления дохода со счетов налоговых агентов в банке на счета налогоплательщика (ст. 226 НК РФ).

Исходный документ Постановление ФАС Западно-Сибирского округа от 29.12.2009 по делу № А46-11967/2009 (не найден)